Ukristo wa Yaquis ndio ulioruhusu dini kuenea mnamo 1609, ikipenya eneo la Sonora.
Wakati wa Ukoloni, Sonora alihusiana tu na mteremko wa Sierra Madre Occidental iliyojumuishwa katika mipaka ya chombo hicho. Kanda ambayo ilielekea kaskazini kutoka Mto Yaqui, pamoja na Real de la Cieneguilla, iliitwa Pimería Baja na mkoa wa kaskazini kabisa kutoka ile Real hadi Mto Colorado - tayari katika jimbo la Arizona la Amerika ya Kaskazini - iliitwa Pimería Alta.
Eneo la sasa la Sonoran pia linajumuisha mkoa mdogo kusini magharibi mwa ile iliyokuwa ikijulikana kama Pimería, iliyoko katika jimbo la Chihuahua na Ostimuri, eneo ambalo liko kwenye pwani za Ghuba ya California, kati ya mito ya Mayo na Yaqui.
Mnamo mwaka wa 1614 wamishonari Pérez de Rivas na Pedro Méndez walibadilisha Wamaya katika eneo la Ostimuri, wakigawanya misheni hiyo katika Wilaya tatu: Santa Cruz (kinywani mwa Mayo), Navojoa na Tesia.
Tepahues walijumuishwa pamoja na Cornicaris mnamo 1620. Padri Miguel Godínez alianzisha ujumbe wa San Andrés de Cornicari na Asunción de Tepahui . Mwaka huo huo Mkoa wa San Ignacio ulianzishwa, ambao ulijumuisha, pamoja na misioni tano zilizotajwa hapo awali, zile za Bacúm, Torín na Rahún, zilizo kinywani mwa Yaqui.
Mnamo 1617 Yaquis walibadilishwa na wazazi Pérez de Rivas na Tomás Basilio. Licha ya mateso ya ghasia, ghasia, mateso, na mauaji, ubadilishaji wa Sonora ulikuwa wa haraka na salama zaidi. Kufikia karne ya 17 Wajesuiti walipanua na kuanzisha utume wa Maycoba na Yecora katika sehemu ya kusini magharibi ya kile walichojua kama Chínipas.
Ujumbe kutoka Mto Yaqui kuelekea kaskazini uligawanywa katika sehemu nne: ile ya San Borja ilipanga ujumbe wa: Cucumaripa na Tecoripa , ilianzishwa mnamo 1619; Movas na Onovas, mnamo 1622; Sahuaripa mnamo 1627; Matape mnamo 1629; Onapa mnamo 1677 na Arivechi , mnamo 1727. Sehemu ya Mashahidi Watakatifu Watatu wa Japani iliyojumuisha Batuco iliyoanzishwa mnamo 1627, Oposura mnamo 1640 na Bacadeguachi , Guazavas , Santa María Baceraca na San Miguel Bavispe , ilianzishwa mnamo 1645. Na Mkoa wa San Javier ambao uliunganisha ujumbe wa Ures mnamo 1636; Aconchi, Opodepe na Banámichi mnamo 1639; Cucurpe na Arizpe mnamo 1648, na Cuaquiárachi mnamo 1655.
Mnamo 1687 mmishonari Eusebio Francisco Kino aliingia Pimería Alta na kuanza misheni ya Rectorate ya Nuestra Señora de los Dolores, akianzisha: Caborca, ambayo Francisco Javier Saeta alipewa jukumu ambaye anahifadhi mawasiliano na msaada wake wa kiroho, baba Kino; Atil, Tubutama, Mama yetu wa Sorrows de Saric, Pitiquito, Aiil, Oquitoa, Magdalena, San Ignacio, Cocóspera na Imuris.
Baada ya kufukuzwa kwa Wajesuiti, misioni walikuwa wakisimamia Wafransisko, ambao hawakujenga zaidi na walijizuia kujaribu kuhifadhi zilizopo. Mara baada ya Wajesuiti walikuwa tayari wameanzisha makazi huko Sinaloa na Sonora, waligeuza macho yao kuelekea eneo la California.
