Mzaliwa wa Ozumba, Jimbo la Mexico, mnamo 1737, alianza kazi ya kidini na akawekwa padri akiwa na umri wa miaka ishirini.
Licha ya mafunzo yake ya kifalsafa, tangu umri mdogo sana amekuwa akihusika na maarifa na matumizi ya sayansi ya asili, fizikia, hisabati na unajimu. Anachapisha kazi muhimu kwenye masomo ya kisayansi kwenye magazeti na majarida ya wakati wake. Anapata sifa ya kimataifa na ameteuliwa mshirika anayehusika wa Chuo cha Sayansi cha Paris. Yeye hutumia wakati wake mwingi kufanya majaribio ya sayansi na kukusanya maktaba kubwa. Yeye ni mkusanyaji wa vipande vya akiolojia na vielelezo adimu vya mimea na wanyama. Gundua Xochicalco. Ili kumpa heshima, mnamo 1884 Jumuiya ya Sayansi ya Antonio Alzate ilianzishwa, ambayo mnamo 1935 ikawa Chuo cha Sayansi cha Kitaifa. Kazi yake ya uhariri inayojulikana zaidi ni noti za Historia ya Kale ya Mexico na Yesuit Francisco Javier Clavijero Inasemekana kwamba yeye ni jamaa wa mbali wa Sor Juana Inés de la Cruz. Alikufa huko Mexico City mnamo 1799.
